博碩士論文 90222031 完整後設資料紀錄

DC 欄位	值	語言
DC.contributor	物理學系	zh_TW
DC.creator	陳鴻大	zh_TW
DC.creator	Hong-Tir Chan	en_US
dc.date.accessioned	2003-7-17T07:39:07Z
dc.date.available	2003-7-17T07:39:07Z
dc.date.issued	2003
dc.identifier.uri	http://ir.lib.ncu.edu.tw:88/thesis/view_etd.asp?URN=90222031
dc.contributor.department	物理學系	zh_TW
DC.description	國立中央大學	zh_TW
DC.description	National Central University	en_US
dc.description.abstract	摘要 根據我們的觀察，基因內不同相位的鹼基，其比例具有明顯的差異，且同一物種的基因比例相同，非編碼段各相位的鹼基則無分別，此種差異應是與密碼子第三碼的簡並特性，經過演化所偏好的選擇有關。 我們的研究關注於DNA上基因的辨識與搜尋，使用Perl電腦程式做為工具，將序列分為三個相位，並對序列的三個相位進行滑動窗口的分析，將各相位間字串出現頻率的差進行評分，並且將三個相位間的評分取平均值和標準差，依此判別一序列編碼的程度高低。 我們利用此法取70餘種細菌的基因、非編碼和隨機序列進行辨識，對不同長度的基因進行分析，訓練出最佳的辨識結果，以及其評分界線。 在基因搜尋當中，編碼區域的平均評分較高，且三個相位間的評分相差甚多，以此可預測基因在序列當中的位置。我們更發現，相位間評分的大小順序，表示基因內相位與序列座標相位間的關係，正反兩股共六個相位的基因皆有其不同的順序。 若是已知基因在序列座標中的相位，配合預測基因的位置，可大幅降低ORF搜尋的範圍以及訊號，甚至能找到正確的起始碼與終止碼配對。	zh_TW
dc.description.abstract	In the bacteria genes, we can identify about 85 % coding part, if the gene large 1000, we can identify near 99 %. We search DNA sequence have 75 % coding location is correct. Read phase order of color can tell us real gene frame, that will help to find correct initiation and termination pair	en_US
DC.subject	枯草桿菌	zh_TW
DC.subject	大腸桿菌	zh_TW
DC.subject	DNA	zh_TW
DC.subject	鹼基比例	zh_TW
DC.subject	ORF	zh_TW
DC.subject	相位	zh_TW
DC.subject	搜尋	zh_TW
DC.subject	辨識	zh_TW
DC.subject	mutation	en_US
DC.subject	Identification	en_US
DC.subject	phase	en_US
DC.subject	bp	en_US
DC.subject	search	en_US
DC.subject	ORF	en_US
DC.subject	gene	en_US
DC.subject	E.coli	en_US
DC.subject	B.subtilis	en_US
DC.title	DNA序列的不同相位上辨識與搜尋基因	zh_TW
dc.language.iso	zh-TW	zh-TW
DC.title	Genes Identification and Searchin Different Phase of DNA Sequence	en_US
DC.type	博碩士論文	zh_TW
DC.type	thesis	en_US
DC.publisher	National Central University	en_US