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姓名	蘇啟仁(Chi-Jen Su)  查詢紙本館藏	畢業系所	物理學系
論文名稱	以Z曲線分析法探索人類基因體之辨識
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摘要(中)	摘要 目前對基因的分析方法有好幾種，而我們使用的方法是根據 Chun-Ting Zhang 所提出的Z 曲線分析法，這個方法是用多變數分析法作 分析，試著用對猜測基因部份作分析。 事實上在基因的判定原則上還是由實驗結果來決定，不過由於實 驗的成本相當的高，且費時，所以由Chun-Ting Zhang 所提出的Z 曲線分 析法可作初步的辨讀，並作探討。 我們對人類的24條染色體(包括2條性染色體)的mRNA部份作分 析，由於人類是真核生物，在轉錄轉譯蛋白質摺疊, 在 這過程中會將內碼子去除再各別將外碼子連接成mRNA，所形成的序 列就是我們要分析的序列。
關鍵字(中)	★ Z曲線	關鍵字(英)	★ Z - Curve
論文目次	目 錄 目錄 I 圖目錄 II 表目錄 IV 第一章 序論 1 第一節 前言 1 第二節 背景資料與歷史回顧 2 第三節 密碼子 3 第二章 分析與方法(Z曲線) 5 第一節 Z 曲線 5 第二節 Z曲線的應用 13 第三節 編碼段及非編碼段的取樣 17 第四節 編碼與非編碼的判斷方法 20 第三章 結果分析 22 第一節 序列分析結果 22 第二節 各組分析結果 36 第四章 總結 44 參考文獻 45
參考文獻	參考文獻 [1] International human genome sequencing consortium, 2001. Initial sequencing and analysis of the human genome. Nature, 409, 824-955. [2] ftp.ncbi.nih.gov/genbomk/genomes/H_sapiens/ [3] B. Lewin, “Gene”, 7th edition, (OXFORD, 2000). [4] Peter H. Raven and George B. Johnson “Biolgy”, 5th edition (McGraw-Hill, Inc., 1999). [5] Neil A. Campbell , Jane B. Reece and Lawrence G. Mitchell, “Biology”, 5th edition (Benjamin/Cummings, 1999). [6] B. Alberts, D. Bray, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, J. D. Watson, ‘‘Molecular Biology of The Cell’’, (Garland, New York, 1994). [7] Zhang, C.-T. & Chou, K.-C. (1994) A graphic approach to analyzing codon usage in 1562 Escherichia coli protein coding sequences. J. Mol. Biol. 238, 1-8. [8] Chun-Ting Zhang and Ju Wang (2000) Recognition of protein coding genes in the yeast genome at better than 95% accuracy based on the Z curve. Nucleic Acids Res., 28, 2804-2814. [9] Ju Wang and Chun-ting Zhang (2001) Identification of protein-coding genes in the genome of Vibrio cholerae with more than 98% accuracy using occurrence frequencies of single nucleotides. Eur. J. Biochem. 268, 4261-4286. [10] Cornish-Bowden, A. (1985) Nucleic Acids Res., 13, 3021-3030. [11] Reginald H. Garrett and Charles M. Grisham, “Biochemistry”, 2th edition, (HARCOURT Inc.,1999). [12] Frederick R. Blattner, Guy Plunkett III,(1997) The Complete Genome Sequence of Escherichia coli K-12. Science. 277, 1453-1462. [13] Nicole T. Perna, Guy Plunkett III,(2001) Genome sequence of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157:H7. Nature. 409, 529-533. [14] Chun-Ting Zhang and Kuo-Chen (1994) A Graphic Approach to Analyzing Codon Usage in 1562 Escherichia coli Protein Coding Sequences. J. Mol. Biol. 238, 1-8. [15] Mardia, K.V. ,Kent, J. and Bibby, J.M.(1979) Multivariate Analysis. Academic Press, London, UK. [16] Chris Burge and Samuel Karlin., J. Mol. Biol (1997) 268,78-94. [17] Moises Burset and Roderic Guigo, Genom [18] John B. Hogenesch, Keith A. Ching, Cell (2001) 106, 413-415.
指導教授	李弘謙(Hoong-Chien Lee)	審核日期	2002-7-19
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