細菌基因體隨機性的統計分析

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范文郎(Wen-Lang Fan) 查詢紙本館藏

畢業系所

物理學系

論文名稱

細菌基因體隨機性的統計分析
(Statistical analysis ofrandomness of bacterial genomes)

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摘要(中)

生物體的遺傳與系統功能的資訊以特殊的編排方式儲存在DNA 列中，而人們很早就發現所有已定序完成的細菌全基因體中，字串出現頻率與隨機序列大不相同。隨機序列的字串應為隨機出現，故字串間隔自然呈指數分佈，實驗驗證亦然。細菌全基因體是高度不隨機的序列，經我們實驗證明，全基因體中幾乎所有字串間隔也都是指數分佈。這表示全基因體雖然非隨機序列，但她每一個字串卻幾乎都
是隨機無關聯的出現。這給了我們一個重要的全基因體形成的訊息。而謝-李為了要解釋全基因體字串出現頻率分佈的譜寬，提出了一種全基因體的生長模型，這種模型的主要機制，是基因體以最高度的隨機片段複製生成。在這種機制下生長的序列，其短字串在序列中幾乎是不關聯的隨機出現，所以可以預測它們的間隔呈指數分佈。這與細
菌全基因體中性質相同。

關鍵字(中)

★ 細菌基因體
★ 指數分佈
★ 基因成長
★ 字串間隔
★ 準複製體

關鍵字(英)

★ bacterial genomes
★ exponential distribution
★ quasireplicas
★ genome growth

論文目次

1 緒論
1.1 前言.................................1
1.2 DNA的簡介............................1
1.3 統計簡介.............................3
1.3.1 伯努力分佈.........................3
1.3.2 二項式分佈.........................4
1.3.3 波松分佈...........................5
1.3.4 指數分佈...........................5
1.4 生物研究資料的取得...................7
1.4.1 生物資料庫.........................8
2 動機與理論
2.1 動機.................................9
2.2 真實序列的字串間隔也似指數分佈.......10
2.3 計算方法.............................12
2.4 基因體的成長模型.....................17
3 數值分析...............................19
4結論....................................44

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指導教授

李弘謙(Hoong-Chien Lee)

審核日期

2004-7-7

推文