博碩士論文 91522081 詳細資訊




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姓名 陳伯良(Pak-Leong Chan)  查詢紙本館藏   畢業系所 資訊工程學系
論文名稱 建立病毒檢測探針設計之平台
(A Platform to Aid Probe Design for Virus Identification)
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摘要(中) 病毒辨認越來越重要,因為病毒不但傳播得很快,而且傳播範圍很廣。在很多的例子中因為沒有很快的辨認病毒而造成了人命和財產的損失。如果有一個資訊系統能夠結合生物科技很快的辨認病毒則病毒學家就會有充份時間去研究應付病毒的方法。我們設計一個病毒探針資料庫,結合快速的演算法,可以在很短的時間找出最佳的生物晶片探針組合來辨認一組病毒。而且我們把整個系統實現在網際網路讓世界各地的使用者能使用我們的系統,另外我們開發一個程序能驗證最佳探針的辨別能力。
摘要(英) Virus identification becomes more and more important. Virus not only spreads widely, but also infects swiftly. In many cases, virus causes severe crises of health and economic loss. If a system integrating biotechnology to identity virus quickly is developed, virologists will have sufficient time to make a strategy of solution and control it. We develop a system and made use of a fast algorithm to aid virus probe design for microarray. This microarray can identity a group of viruses. The system is implemented and published to the internet so that all users can access the system through the internet at any time. The specificities of optimal probes are verified by the local alignment tool.
關鍵字(中) ★ 棎針設計 關鍵字(英) ★ bioinformatics
論文目次 Chapter 1 Introduction 1
Chapter 2 Related Works 3
2.1 Microarray 3
2.2 Criteria for designing probes 4
2.3 Optimal probe for microarrays 7
Chapter 3 System and Methods 8
3.1 Data preparation 8
3.2 Generating probe candidates 9
3.3 System flow 10
Chapter 4 Algorithms and Implementation 13
4.1 The longest increasing subsequence algorithm 13
4.2 Selecting the optimal probe 17
4.3 Verifying the selection of optimal probe 18
Chapter 5 Results 21
5.1 The online system 21
5.2 Comparison of different methods in probe design 26
5.3 Evaluation of selection of optimal probe 26
Chapter 6 Discussions 30
References 37
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指導教授 張猷忠、洪炯宗
(Yu-Chung Chang、Jorng-Tzong Horng)
審核日期 2004-7-12
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