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    題名: DNA甲基化的數據分析以及演算預測;Data Analysis and Computational Prediction of DNA Methylation
    作者: 王孫崇
    貢獻者: 生物資訊與系統生物研究所
    關鍵詞: 單一核.酸多型性;表觀遺傳學;DNA 甲基化;微陣列晶片;亞硫酸氫鈉;序列模組;物理類
    日期: 2008-07-01
    上傳時間: 2010-12-28 15:35:00 (UTC+8)
    出版者: 行政院國家科學委員會
    摘要: 核.酸序列的變化,特別是單一核.酸多型性,是造成表現型多樣的重要因素之一。在人類的基因體中,迄今已經發現超過四百萬個位子上具有單一核.酸多型性。許多的研究,也投入於尋找引起疾病的單一核.酸多型性。與此同時,核.酸序列的化學狀態,例如胞嘧啶的甲基化與否,會影響此序列的表現。同等重要的發現是,核.酸序列上的這些化學修飾,是可遺傳的。這種不藉由核.酸序列的變異,而引起基因功能的遺傳改變的學科,稱為表觀遺傳學。高通量的基因表現,和DNA 甲基化的測量技術都已逐漸成熟。一起考慮這兩個遺傳因子的研究手段,可以提供研究者更多的資訊。例如,在實驗組和對照組間有表現差異的基因,如果也顯現甲基化狀態的差別,那麼這些基因是非常值得我們做進一步的探究。另一種DNA 甲基化的檢測,牽涉到核.酸序列的亞硫酸氫鈉處理。這種方法的結果比較精確可靠,但是其缺點是低通量,而且費用較昂貴。本計劃藉由單一核.酸多型性與DNA 甲基化的交互作用研究,來增進我們對於表現型遺傳的瞭解。特定地說,我們將發展一種度量,來敏銳的量化出亞硫酸氫鈉處理過的序列數據。我們也將發展一套演算法,來快速地找出DNA 甲基化的微陣列晶片序列中的單一核.酸多型性。另外,我們也將尋找與DNA 甲基化相關的序列模組。我們預計我們所發展出度量,會廣泛地被同業所採用。我們會架設一伺服器,來推廣我們所發展的快速演算法。我們的序列模組研究,也會讓我們進一步認識DNA 新甲基化的成因。 研究期間:9608 ~ 9707
    關聯: 財團法人國家實驗研究院科技政策研究與資訊中心
    顯示於類別:[系統生物與生物資訊研究所] 研究計畫

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